南繁基地是我國最大的農業科技試驗平臺，是育種加代、種子生產、制種繁種等不可替代的戰略資源，每年均有大批量種苗調入、調出，有害生物隨種苗傳播擴散的風險也非常高。近年來，農業農村部種植業管理司會同全國農技中心，以“強化植物檢疫、保障種業安全”為目標，不斷完善機制、優化措施，連續五年開展植物檢疫聯合巡查，有效提升了國家南繁基地檢疫安全水平。

落實“植物檢疫機構輪流值守、科研單位駐守”的南繁基地植物檢疫協作機制，制定年度聯合巡查方案，明確工作目標，強化南繁檢疫巡查值守，不斷提升產地檢疫覆蓋面。近5年，29個省(區、市)植物檢疫機構累計選派36批次550余名專職植物檢疫員參與產地巡查，累計巡查南繁單位2627家（次），面積22.5萬畝。依托全國聯合巡查機制，海南省不斷強化自身能力建設，先后印發《關于南繁六市縣聯合開展產地檢疫工作的通知》和《海南省農作物種子調運管理工作方案》，組織開展省內聯檢8次，檢查范圍包括24個重點鄉鎮、50多家快遞物流企業、3個碼頭、2個機場，在種子生產、流通多個環節加強檢疫管理。

采用瓜類果斑病菌、黃瓜綠斑駁花葉病毒、番茄褐色皺紋果病毒、玉米褪綠斑駁病毒等快速檢測試紙條和試劑盒，強化與科研教學單位的合作，做到重點高風險點位全監測、申報單位全抽樣、抽樣樣品全檢測。近5年，累計開展3200批次田間初篩，采集4000批次樣品進行室內檢測，及時發現確認紅火蟻、水稻細菌性條斑病、黃瓜綠斑駁花葉病毒、番茄潰瘍病、假高粱、瓜類果斑病、番茄褐色皺果病毒、扶桑棉粉蚧等8種植物疫情，其中瓜類果斑病、番茄褐色皺果病毒為海南省首次發現。

針對水稻細菌性條斑病、假高粱等已傳入疫情，推行預防控制、統防統治，壓縮疫情發生區域。對零星發生的番茄潰瘍病、瓜類果斑病等疫情，聯合農業綜合執法部門、市縣農業農村部門，指導涉疫單位進行封鎖撲滅，及時查處違反《植物檢疫條例》《南繁管理條例》的單位，構建依法開展南繁生產的良好氛圍。近5年，水稻細菌性條斑病發生面積壓縮到3000畝，大部分發生點為零星發生，確保南繁制種生產安全，防范了病害隨種子調運至其他省（區）；假高粱發生面積600畝，比嚴重發生的2018年減少900畝，減幅59%。

依托全國植物檢疫信息化管理系統，開發南繁檢疫專項業務版塊，南繁單位可在線提交檢疫申報信息，實時查詢檢疫進度，無需到現場辦理申報、辦證等手續，極大的方便了南繁單位，南繁檢疫申報率得以持續上升。在此基礎上，依托南繁管理平臺開發田間調查APP，檢疫員可現場填寫田間調查記錄，全面提高南繁植物檢疫服務水平。2023—2024年南繁季，1073家南繁單位通過系統辦理檢疫事務，與2019—2020年度的660家相比，增長62.5%，越來越多的南繁單位主動配合植物檢疫。